1. ESM de classe I : enceinte de manipulation partiellement ouverte sur le devant et construite de manière à minimiser, grâce à un système d'aspiration créant une dépression, l'échappement d'aérosols générés à l'intérieur de celle-ci. La circulation de l'air est similaire à celle d'une hotte chimique. Toutefois, l'air évacué en partie haute doit être filtré au travers d'au moins un filtre HEPA avant rejet. Le flux d'air entre à une vitesse comprise entre 0,7 et 1 m/s et n'est pas filtré. Ce type d'enceinte assure une protection du manipulateur et de l'environnement mais pas de l'échantillon manipulé. La face frontale est constituée d'une paroi transparente qui délimite une ouverture fixe et comprise entre 20 et 25 cm. L'air sortant peut être rejeté directement dans le laboratoire ou à l'extérieur via un système d'évacuation.

2. ESM de classe II : enceinte de manipulation partiellement ouverte sur le devant, dans laquelle s'écoule verticalement un flux d'air laminaire descendant stérile et construite de manière à minimiser, grâce à une dépression créant un flux d'air entrant en façade ("barrière d'air" ou "veine de garde"), l'échappement d'aérosols générés à l'intérieur de celle-ci. Le courant laminaire d'air qui s'écoule dans le volume de travail est aspiré au voisinage du plan de travail ou au travers de celui-ci lorsqu'il est perforé. L'air sortant en partie haute doit être filtré au travers d'au moins un filtre HEPA et peut être rejeté directement dans le laboratoire ou à l'extérieur via un système d'évacuation. Ce type d'enceinte assure une protection du manipulateur, de l'environnement et de l'échantillon manipulé. La norme européenne relative aux critères de performance pour les postes de sécurité microbiologique (norme EN12469) prévoit des dispositions pour la sécurité environnementale.

Complément d'information: la chambre de manipulation est alimentée par un flux d'air filtré (filtre absolu), uniforme et unidirectionnel, dirigé vers le bas. La laminarité du flux est assurée par la géométrie de la chambre de manipulation et celle de la chambre de surpression en amont du filtre et par une répartition homogène de la vitesse du flux : 0,4 m/s ± 20% en tous points. Le flux est repris dans les bandeaux d'aspiration à l'avant et à l'arrière du plan de travail puis soufflé par le ventilateur dans la chambre de surpression et dirigé vers le filtre de rejet ou à nouveau dans la chambre de manipulation après filtration. L'éclairage est situé en dehors de la chambre afin de ne pas perturber le flux laminaire. La vitesse de l'air laminaire est comprise entre 0,25 et 0,45 m/s (idéalement 0,40 m/s) et celle du flux d'air entrant entre 0,38 et 0,70 m/s (idéalement 0,50 m/s). La face frontale est constituée d'une fenêtre glissante, amovible ou fixe en verre sécurit avec une ouverture de 20 ou 25 cm lors des manipulations. Contrairement aux enceintes de classe I, l'échantillon est protégé des contaminations croisées pouvant venir du volume de travail par le flux laminaire vertical filtré et des contaminations extérieures par le fait que l'air entrant en façade est directement piégé dans des orifices placés en partie avant du plan de travail. Selon le modèle choisi, ces enceintes seront équipées de un ou de deux motoventilateurs et de lampes UV.

Types d'ESM de classe II: type A et B

• Dans les ESM de type IIA, l'air potentiellement contaminé est transféré vers la partie supérieure et le ventilateur sans filtration. Dans certains dispositifs selon l'emplacement du/des ventilateur(s), le conduit de transfert vers la partie supérieure est sous pression positive des fuites d'air contaminé pourraient donc survenir dans le laboratoire ou dans le volume de travail (conception d'enceinte déconseillée). Dans les autres réalisations, le conduit est sous pression négative et les fuites d'air sont alors évitées.
• Dans les ESM de type IIB, le conduit  de transfert ne transporte que de l'air filtré et sous pression négative. L'intérêt des ESM de classe II type B réside dans le fait qu'ils permettent la manipulation de substances toxiques volatiles.